V programu Company Manager probíhá protokolování dokladů dvěma způsoby.

1. Protokol o dokladu je zobrazen v každé agendě v menu. Automaticky protokolují vybrané akce v jednotlivých konkrétních agendách. Například vytištění faktury, editace dříve vytištěné faktury. Storno tisknuto, storno dokladu atd.

Protokol o dokladu

2. Ukládání protokolu do souboru Proto_CD - tento protokol je pro všechny agendy společný. Do tohoto protokolu se zapisují změny v tabulce, které byly provedeny pomocí obecných obrázkových tlačítek na kartě nebo v rozpisu dokladu. (nebo samozřejmě pomocí příslušných rychlých kláves).

Ukládání protokolu do souboru Proto_CD -> prohlížení těchto protokolů viz Protokol změn dokladů

Protokoly o odeslaných e-mailech a provedených zálohách programu viz Protokoly.