V peněžním deníku se zadávají úhrady vydaných a přijatých faktur bankou nebo v hotovosti pokladnou. Úhrady lze zapsat ručně nebo využít informace z agend faktur, přijatých nebo vydaných. nalezení faktury, rozúčtování faktury. K tomu se používají tyto činnosti:

• Párování úhrady s fakturou

• Rozúčtování úhrady podle faktury (klávesová zkratka "r") - Rozúčtování částky na základ a DPH při zápisu řádku běžného účtu nebo pokladny. Rozúčtování probíhá podle faktur, které jsou evidovány v agendách Přijaté nebo Vydané faktury. Bere se do úvahy i částečná úhrada. Přednost při částečné úhradě má DPH.

• Vkládání úhrad - klávesové zkratky, které vloží nový řádek (řádky) jako úhradu faktury/ Ostatních závazků.